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La NADH deidrogenasi di tipo II

Un enzima respiratorio che serve ai batteri ma non a noi, e quindi un possibile bersaglio per gli antibiotici.

Il dimero di NDH-2 (arancione pallido e oro) con il FAD (prugna) e il NAD (rosa) legati in ogni subunità.

La NADH deidrogenasi di tipo II (NDH-2) immette elettroni nella catena respiratoria di molti batteri, patogeni compresi, ma l’uomo e gli altri mammiferi non ce l’hanno. Questo ne fa un bersaglio promettente per nuovi antibiotici. Insieme ai gruppi di Greg Cook e Yoshio Nakatani in Nuova Zelanda e a quello di Judy Hirst a Cambridge, le strutture di Caldalkalibacillus thermarum, insieme a cinetica e mutagenesi, hanno mostrato che l’enzima gestisce i suoi due substrati in siti separati, chiudendo anni di risultati contrastanti su come funziona (articolo).

I cristalli erano piccoli, diffrangevano poco e soffrivano di danno da radiazione. Per ottenere un set di dati utilizzabile abbiamo dovuto raccogliere con un fascio microfocus da decine di cristalli e scegliere i settori di dati migliori da unire.

Codice PDB
5KMR su PDBe (anche su RCSB PDB)
Pubblicata
2017-01-25
Risoluzione
3 Å
Articolo
The mechanism of catalysis by type-II NADH:quinone oxidoreductases. (Sci Rep, 2017)
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Dettagli tecnici, link e densità elettronica

Immagini e video realizzati con UCSF ChimeraX; la vista in 3D è PDBe Mol*.

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