La ferredossina con zinco di Acidianus ambivalens

Una piccola proteina di un archeo delle sorgenti calde, con sette atomi di ferro in due cluster e uno zinco, tutti intatti.

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Le ferredossine sono piccole proteine che trasportano elettroni nella cellula. Questa viene da Acidianus ambivalens, un archeo che vive in sorgenti vulcaniche calde e acide. Porta sette atomi di ferro in due cluster ferro-zolfo, un [3Fe-4S] e un [4Fe-4S], e lega anche uno zinco. Una struttura precedente di una ferredossina affine aveva i cluster convertiti artificialmente; qui entrambi i cluster e il sito dello zinco sono intatti, proprio come li produce l’organismo, a 2,0 Å di risoluzione (articolo).

È anche una delle prime proteine che ho cristallizzato. Ho fatto crescere i cristalli all’ITQB intorno al 2000, tra il progetto di tesi di laurea e il dottorato. Diffrangevano a 2,0 Å ma erano geminati, ognuno con una frazione di geminazione diversa, quindi la struttura ha richiesto molto tempo per essere risolta e raffinata. Alla fine la biochimica ha recuperato terreno, era importante far uscire la struttura, ed è stata pubblicata nel 2008.