La ferredoxina con zinc de Acidianus ambivalens

Una pequeña proteína de una arquea de fuentes termales con siete átomos de hierro en dos clústeres, más un zinc, todo intacto.

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Las ferredoxinas son proteínas pequeñas que transportan electrones por la célula. Esta viene de Acidianus ambivalens, una arquea que vive en fuentes volcánicas calientes y ácidas. Lleva siete átomos de hierro en dos clústeres de hierro y azufre, uno [3Fe-4S] y otro [4Fe-4S], y además une un zinc. Una estructura anterior de una ferredoxina emparentada tenía los clústeres convertidos artificialmente; aquí los dos clústeres y el sitio del zinc están intactos, tal como los fabrica el organismo, a 2,0 Å de resolución (artículo).

También es una de las primeras proteínas que cristalicé. Obtuve los cristales en el ITQB hacia el año 2000, entre mi proyecto de fin de carrera y el doctorado. Difractaban a 2,0 Å pero estaban maclados, cada uno con una fracción de maclado distinta, así que la estructura tardó mucho en resolverse y refinarse. Al final la bioquímica se puso al día, era importante publicar la estructura, y salió en 2008.