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Le cytochrome c3 de Desulfovibrio gigas

La première structure que j'ai affinée et publiée, issue de la bactérie découverte par Jean LeGall.

Le dimère avec ses huit hèmes, quatre par sous-unité (prune et rose), et leurs atomes de fer (brun).

Un cytochrome c3 dimérique, une petite protéine bourrée de quatre groupes hème, de Desulfovibrio gigas, affiné à 1,2 Å. En le comparant à tous les cytochromes c3 connus à l’époque, on a vu des régions qui restent les mêmes malgré des séquences très différentes, et une molécule d’eau enfouie qui fait probablement passer les électrons entre deux des hèmes (article).

Carlos Frazão avait collecté les données à l’EMBL de Hambourg en 1997 ; je les ai traitées et affinées, et j’ai écrit l’article comme jeune chercheur dans son groupe, avant qu’il devienne mon directeur de thèse. C’est donc la première structure que j’ai vraiment faite mienne, et elle relie des gens qui ont beaucoup compté pour moi : D. gigas est la bactérie que Jean LeGall a décrite le premier en 1963, et Larry Sieker et Maria Arménia Carrondo font partie des coauteurs.

Entrée PDB
1GYO sur PDBe (aussi sur RCSB PDB)
Mise en ligne
2002-05-24
Résolution
1.2 Å
Article
Structure of Dimeric Cytochrome C3 from Desulfovibrio Gigas at 1.2 A Resolution (Acta Crystallogr.,Sect.D, 2003)
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Détails techniques, liens et densité électronique

Images et vidéo rendues avec UCSF ChimeraX ; la vue 3D est PDBe Mol*.

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